故事以只有女性能使用的世界最強兵器「InfiniteStratos(IS)」為中心,在女尊男卑的世界中,主角「織斑一夏」雖然身為男生卻能夠操縱IS,為此他被強制進入培育IS操縱者的學校「IS學園」,周圍理所當然也都是女性,而女生們也對這位「世上唯一能夠使用IS的男性」感到興趣,就此展開了許多趣味橫生的學校生活。
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